Mais d’après une source du journal anglais Daily Mail, la raison de cette séparation serait toute autre. Adepte de l’Eglise de Scientologie, la chanteuse n’aurait pas supporté que son époux n’y soit pas attaché, voire réticent : « Jennifer et Marc n'étaient pas d'accord sur le sujet. Elle a toujours été plus intéressée par l'Eglise que par lui. »
Jennifer Lopez aurait notamment décidé que leurs jumeaux, Max et Emma, feraient leur scolarité dans une école scientologue, ce à quoi s’oppose fermement Marc Anthony. Le bel hidalgo aurait-il peur que ses enfants ressemblent trop à Suri, la petite princesse solitaire de Katie Holmes et Tom Cruise ?